MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter cinaedi ATCC BAA-847 DNA

Total Repeats: 39440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020555	ATA	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314538
2	NC_020555	A	7	7	21	27	100 %	0 %	0 %	0 %	471314538
3	NC_020555	ATG	2	6	83	88	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314538
4	NC_020555	T	6	6	116	121	0 %	100 %	0 %	0 %	471314538
5	NC_020555	AT	3	6	131	136	50 %	50 %	0 %	0 %	471314538
6	NC_020555	GGA	2	6	192	197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471314538
7	NC_020555	A	7	7	242	248	100 %	0 %	0 %	0 %	471314538
8	NC_020555	CT	3	6	307	312	0 %	50 %	0 %	50 %	471314538
9	NC_020555	CAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471314538
10	NC_020555	TGT	2	6	422	427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314538
11	NC_020555	TGT	2	6	480	485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314538
12	NC_020555	GCT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314538
13	NC_020555	ATTG	2	8	609	616	25 %	50 %	25 %	0 %	471314538
14	NC_020555	ATG	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314538
15	NC_020555	AG	3	6	640	645	50 %	0 %	50 %	0 %	471314538
16	NC_020555	AAG	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314538
17	NC_020555	TA	3	6	683	688	50 %	50 %	0 %	0 %	471314538
18	NC_020555	CA	3	6	690	695	50 %	0 %	0 %	50 %	471314538
19	NC_020555	TGA	2	6	707	712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314538
20	NC_020555	AGA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314538
21	NC_020555	ATT	2	6	826	831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314538
22	NC_020555	AATC	2	8	846	853	50 %	25 %	0 %	25 %	471314538
23	NC_020555	TGAT	2	8	875	882	25 %	50 %	25 %	0 %	471314538
24	NC_020555	TC	3	6	930	935	0 %	50 %	0 %	50 %	471314538
25	NC_020555	ATA	2	6	1043	1048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314538
26	NC_020555	TTG	2	6	1058	1063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314538
27	NC_020555	GTG	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314538
28	NC_020555	GAT	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314538
29	NC_020555	GAG	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471314538
30	NC_020555	CAG	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314538
31	NC_020555	GAA	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314539
32	NC_020555	GTT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314539
33	NC_020555	TAT	2	6	1651	1656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314539
34	NC_020555	TCTTAT	2	12	1780	1791	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	471314539
35	NC_020555	ATG	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314539
36	NC_020555	TGG	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314539
37	NC_020555	ATT	2	6	1857	1862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314539
38	NC_020555	T	6	6	1904	1909	0 %	100 %	0 %	0 %	471314539
39	NC_020555	GAAT	2	8	2071	2078	50 %	25 %	25 %	0 %	471314539
40	NC_020555	T	7	7	2089	2095	0 %	100 %	0 %	0 %	471314539
41	NC_020555	T	6	6	2115	2120	0 %	100 %	0 %	0 %	471314539
42	NC_020555	T	6	6	2256	2261	0 %	100 %	0 %	0 %	471314539
43	NC_020555	GCA	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314539
44	NC_020555	AAT	2	6	2420	2425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314539
45	NC_020555	GCA	2	6	2471	2476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314539
46	NC_020555	GT	3	6	2493	2498	0 %	50 %	50 %	0 %	471314539
47	NC_020555	CA	3	6	2527	2532	50 %	0 %	0 %	50 %	471314539
48	NC_020555	GGC	2	6	2549	2554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471314539
49	NC_020555	TAT	2	6	2581	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314539
50	NC_020555	AAG	2	6	2630	2635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314539
51	NC_020555	CTT	2	6	2678	2683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314540
52	NC_020555	AAACTC	2	12	2715	2726	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	471314540
53	NC_020555	CTG	2	6	2764	2769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314540
54	NC_020555	TGA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314540
55	NC_020555	CTAGTC	2	12	2921	2932	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	471314540
56	NC_020555	AAG	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471314540
57	NC_020555	TCA	2	6	3031	3036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
58	NC_020555	AC	3	6	3077	3082	50 %	0 %	0 %	50 %	471314540
59	NC_020555	AGTG	2	8	3117	3124	25 %	25 %	50 %	0 %	471314540
60	NC_020555	TCT	2	6	3148	3153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314540
61	NC_020555	TAA	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314540
62	NC_020555	AAT	2	6	3240	3245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314540
63	NC_020555	T	6	6	3261	3266	0 %	100 %	0 %	0 %	471314540
64	NC_020555	TAA	2	6	3296	3301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314540
65	NC_020555	ATC	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
66	NC_020555	TTTG	2	8	3372	3379	0 %	75 %	25 %	0 %	471314540
67	NC_020555	TC	3	6	3403	3408	0 %	50 %	0 %	50 %	471314540
68	NC_020555	TTGT	2	8	3409	3416	0 %	75 %	25 %	0 %	471314540
69	NC_020555	T	6	6	3497	3502	0 %	100 %	0 %	0 %	471314540
70	NC_020555	TGC	2	6	3535	3540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314540
71	NC_020555	TCA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
72	NC_020555	TCA	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
73	NC_020555	AAAGC	2	10	3587	3596	60 %	0 %	20 %	20 %	471314540
74	NC_020555	TG	3	6	3598	3603	0 %	50 %	50 %	0 %	471314540
75	NC_020555	GAT	2	6	3606	3611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314540
76	NC_020555	CTT	2	6	3629	3634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314540
77	NC_020555	GA	3	6	3637	3642	50 %	0 %	50 %	0 %	471314540
78	NC_020555	G	6	6	3681	3686	0 %	0 %	100 %	0 %	471314540
79	NC_020555	CTT	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314540
80	NC_020555	CA	3	6	3767	3772	50 %	0 %	0 %	50 %	471314540
81	NC_020555	GCC	2	6	3827	3832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471314540
82	NC_020555	TGC	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314540
83	NC_020555	TG	3	6	3892	3897	0 %	50 %	50 %	0 %	471314540
84	NC_020555	GAAT	2	8	3921	3928	50 %	25 %	25 %	0 %	471314540
85	NC_020555	TCT	2	6	3968	3973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471314540
86	NC_020555	GA	3	6	3977	3982	50 %	0 %	50 %	0 %	471314540
87	NC_020555	TG	3	6	4141	4146	0 %	50 %	50 %	0 %	471314540
88	NC_020555	ATC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
89	NC_020555	ATC	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314540
90	NC_020555	AGC	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314540
91	NC_020555	GAAT	2	8	4432	4439	50 %	25 %	25 %	0 %	471314540
92	NC_020555	GTG	2	6	4489	4494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314540
93	NC_020555	TGG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314540
94	NC_020555	ATA	2	6	4522	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314540
95	NC_020555	G	6	6	4588	4593	0 %	0 %	100 %	0 %	471314540
96	NC_020555	CATT	2	8	4657	4664	25 %	50 %	0 %	25 %	471314541
97	NC_020555	CAC	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471314541
98	NC_020555	ACT	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314541
99	NC_020555	ATCAAT	2	12	4779	4790	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	471314541
100	NC_020555	GTG	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314541
101	NC_020555	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314541
102	NC_020555	AGGCAC	2	12	4896	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314541
103	NC_020555	ACGC	2	8	4908	4915	25 %	0 %	25 %	50 %	471314541
104	NC_020555	TTG	2	6	4982	4987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471314541
105	NC_020555	AAT	2	6	4989	4994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314541
106	NC_020555	GCA	2	6	5005	5010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471314541
107	NC_020555	TG	3	6	5074	5079	0 %	50 %	50 %	0 %	471314541
108	NC_020555	TCA	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314541
109	NC_020555	AGAT	2	8	5171	5178	50 %	25 %	25 %	0 %	471314541
110	NC_020555	T	6	6	5283	5288	0 %	100 %	0 %	0 %	471314541
111	NC_020555	GTG	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314541
112	NC_020555	TTA	2	6	5374	5379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314541
113	NC_020555	TG	3	6	5389	5394	0 %	50 %	50 %	0 %	471314541
114	NC_020555	GT	3	6	5429	5434	0 %	50 %	50 %	0 %	471314541
115	NC_020555	GT	3	6	5469	5474	0 %	50 %	50 %	0 %	471314541
116	NC_020555	CA	3	6	5549	5554	50 %	0 %	0 %	50 %	471314541
117	NC_020555	ATTG	2	8	5610	5617	25 %	50 %	25 %	0 %	471314541
118	NC_020555	TAGG	2	8	5780	5787	25 %	25 %	50 %	0 %	471314542
119	NC_020555	TAT	2	6	5885	5890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314542
120	NC_020555	GTG	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314542
121	NC_020555	TGGCG	2	10	6072	6081	0 %	20 %	60 %	20 %	471314542
122	NC_020555	GCG	2	6	6169	6174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471314542
123	NC_020555	GT	4	8	6265	6272	0 %	50 %	50 %	0 %	471314542
124	NC_020555	TTA	2	6	6293	6298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314542
125	NC_020555	A	7	7	6361	6367	100 %	0 %	0 %	0 %	471314542
126	NC_020555	TCA	2	6	6377	6382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471314542
127	NC_020555	GAG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471314542
128	NC_020555	TGG	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471314542
129	NC_020555	GGAG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	471314542
130	NC_020555	CA	3	6	6487	6492	50 %	0 %	0 %	50 %	471314542
131	NC_020555	TG	3	6	6515	6520	0 %	50 %	50 %	0 %	471314543
132	NC_020555	GGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471314543
133	NC_020555	CAAG	2	8	6820	6827	50 %	0 %	25 %	25 %	471314543
134	NC_020555	TAT	2	6	6844	6849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471314543
135	NC_020555	CTG	3	9	6871	6879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471314543
136	NC_020555	ATA	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471314543
137	NC_020555	TGA	2	6	7042	7047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471314543
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